至元四年（1338年）春正月丙申日，因为发生地震，朝廷大赦天下。下诏：“朝廷内外廉洁能干的官员，父母年满七十岁且没有侍奉的子女的，在其家附近选官任职，以便侍奉赡养父母。”宣政院使不兰奚因年届七十退休，被授予大司徒，终身给予全额俸禄。癸卯日，太白星侵犯建星，甲辰日，再次侵犯。丙午日，月亮侵犯五车星。辛亥日，月亮侵犯轩辕星。己未日，土星侵犯东咸星。江浙海运粮食数量不足，调拨江西、河南五十万石进行补充。庚申日，月亮进入南斗星区域，太白星侵犯牛宿。辛酉日，分别任命宗王乃马歹为知行枢密院事。癸亥日，印造钞本一百二十万锭。当月，朝廷下诏修缮曲阜孔子庙。
二月丁卯日，撤销河南、江浙、湖广、江西、四川等地的行枢密院。戊辰日，祭祀社稷。庚午日，皇帝前往柳林打猎。戊寅日，月亮侵犯轩辕星。己卯日，月亮侵犯灵台星。乙酉日，奉圣州发生地震。当月，赈济京师、黄河南北遭受水灾的百姓。龙兴路南昌州闹饥荒，用江西海运的粮食进行赈济出售。
三月戊申日，土星退行侵犯东咸星。辛酉日，命中书平章政事阿吉剌监修《至正条格》。在南郊进行告祭。任命国王朵儿只为辽阳行省左丞相，宗王玉里不花为知枢密院事，赐钞一千锭、黄金一锭、白银十锭。
夏四月辛未日，京师天空降下红沙，白天变得昏暗。任命探马赤、只儿瓦歹为中书平章政事。癸酉日，任命脱脱为御史大夫。乙亥日，任命阿吉剌为奎章大学士兼主持经筵事务。己卯日，皇帝前往上都巡视。河南将棒胡押解到京师，将其诛杀。癸巳日，皇帝傍晚到达八里塘，天降冰雹，大如拳头，形状有小儿、环玦、狮、象、龟、卵等样子。
五月乙未日，设立五台山等处巡检司。庚戌日，将两淮屯田打捕总管府升为正三品。甲寅日，追赠湖广行省平章政事燕赤为推诚翊戴安边制胜功臣、太傅、开府仪同三司、上柱国，追封永平王，谥号忠襄。辛酉日，朝廷下诏：“土番宣慰司的军士，允许骑马，持有兵器。”湖广行省原本统领新化洞、古州、潭溪、龙里、洪州等三百多个洞，洞民六万多户，分别隶属于靖州，设立叙南、横江巡检司。当月，任命佛家闾为考功郎中，乔林为考功员外郎，魏宗道为考功主事，考核天下郡县官员的功过。任命阿剌吉再次担任中书平章政事。彰德进献祥瑞的麦子，一茎三穗。临沂、费县发生水灾，发放三万石米进行赈济出售。六月庚午日，广东廉访司佥事恩莫绰进言：“处决重刑囚犯，应该命令五府官员斟酌各地距离远近，预先挑选官员分别前往各道，在秋分时之前完成此事。”朝廷采纳了这一建议。辛巳日，袁州百姓周子旺造反，僭称周王，私自更改年号，不久被擒获，伏法被诛。土星退行侵犯键闭星。壬午日，设立重庆路垫江县。己丑日，邵武路下大雨，洪水涌入城内，平地水深一丈。当月，信州路灵山崩裂。漳州路南胜县百姓李志甫造反，包围漳城，守将搠思监迎战，失利。朝廷下诏让江浙行省平章别不花，统领浙闽、江西、广东军队前去征讨。
秋七月壬寅日，朝廷下诏因为伯颜有功，在涿州、汴梁为他建立生祠。己酉日，奉圣州发生大地震，损坏百姓房屋。丙辰日，巩昌府发生山崩，压死百姓。戊午日，为伯颜设立打捕鹰房诸色人户总管府。
八月癸亥初一，发生日食。戊辰日，祭祀社稷。己巳日，重申禁止索取高丽女子及阉人的禁令。追赠伯颜察儿为守诚佐治安惠世美功臣、太师、开府仪同三司、上柱国，追封奉元王，谥号忠宣。辛未日，宣德府发生大地震。癸酉日，山东盐运司在济南历城设立滨洛盐仓东西二场。丙子日，京师发生地震，一天两三次，到乙酉日才停止。丁酉日，白虹贯穿天空。癸未日，将宣德府改为顺宁府，奉圣州改为保安州。追赠太保曲出为推忠翊运保宁一德功臣、太师、开府仪同三司、上柱国，追封广阳王，谥号忠惠。追赠平章伯帖木儿为宣忠济美协诚正德功臣、太傅、开府仪同三司、上柱国，追封文安王，谥号忠宪。甲申日，云南老告土官八那派侄子那赛带着象马前来朝见，朝廷为其设立老告军民总管府。当月，皇帝从上都返回。
闰八月戊戌日，太阳红得如同赭石，己亥日，同样如此。土星侵犯罚星，月亮侵犯斗宿。壬寅日，太阳红得如同赭石。庚戌日，月亮侵犯斗宿。乙卯日，月亮侵犯鬼宿。
九月丙寅日，月亮侵犯斗宿。戊辰日，太白星侵犯东咸星。癸酉日，有流星如杯子般大小，颜色发白，从右旗星下方升起，向西南方向运行，消失在近浊之处。甲申日，月亮侵犯轩辕星。乙酉日，月亮侵犯灵台星。庚寅日，太阳红得如同赭石，太白星侵犯斗宿。
冬十月辛卯日，在太庙祭祀。辛亥日，月亮侵犯酒旗星。
十一月丙寅日，将英宗殿名改为昭融。丁卯日，设立绍熙府军民宣抚都总使司，任命御史大夫脱脱兼任都总使，治书侍御史吉当普为副都总使，世袭其职。本府原本统领六个州、二十个县、一百五十二镇，建国初期，因为此地荒凉而废弃；到这时居民有二十多万，所以设立府进行治理。乙巳日，任命平章政事孛罗统领太常礼仪院使。火星侵犯氐宿。丁丑日，月亮侵犯鬼宿。戊寅日，太白星侵犯垒壁阵星。壬午日，四川散毛洞蛮造反，朝廷派遣使者赈济被贼寇侵扰的百姓。
十二月甲午日，在大都南城等地设立二十个米铺，每个米铺每天出售五十石米，用来救济贫民，等到秋天粮食成熟后停止。戊戌日，设立邦牙等处宣慰司都元帅府以及总管府。在此之前，世祖平定缅地后，因为那里处于云南极边之地，就任命当地酋长为帅，命令他们三年进贡一次，到这时前来进贡，所以设立官府。庚子日，火星侵犯房宿。壬寅日，任命宣徽使别儿怯不花为御史大夫。癸卯日，太白星白天出现在天空，己酉日，再次出现。庚戌日，给荆王脱脱木儿加元德上辅广中宣义正节振武佐运功臣的称号。太白星白天出现在天空。辛亥日，同样如此。壬子日，火星侵犯东咸星。乙卯日，太白星侵犯外屏星，月亮侵犯斗宿。丙辰日，太白星白天出现在天空。
至元五年（1339年）春正月癸亥日，朝廷禁止随意赐予僧人名号爵位。庚午日，月亮侵犯井宿。乙亥日，火星侵犯天江星。濮州鄄城、范县闹饥荒，朝廷赈济二千一百八十锭钞。冀宁路交城等县闹饥荒，赈济七千石米。桓州闹饥荒，赈济二千锭钞。云需府闹饥荒，赈济五千锭钞。开平县闹饥荒，赈济两个月的米。兴和宝昌等地闹饥荒，赈济一万五千锭钞。
二月庚寅日，信州天空落下尘土。甲午日，月亮侵犯昴宿。戊戌日，祭祀社稷。庚子日，免除广海新增的一万五千引盐课，只征收原来的数额。壬寅日，月亮侵犯灵台星。
三月辛酉日，八鲁剌思千户所的百姓受灾，朝廷派遣太禧宗禋院断事官塔海发放米进行赈济。戊辰日，滦河过冬的怯怜口百姓闹饥荒，每户赈济粮食一石、钞二十两。
夏四月辛卯日，撤销兴州兴安县。癸巳日，树立伯颜南口过街塔的两块石碑。乙未日，加封孝女曹娥为慧感灵孝昭顺纯懿夫人。壬寅日，月亮侵犯日星以及房宿。己酉日，重申禁止汉人、南人、高丽人持有军器、弓矢的禁令。当月，皇帝前往上都巡视。
五月己未初一，晃火儿不剌、赛秃不剌、纽阿迭列孙、三卜剌等处的六爱马遭遇大风雪，百姓闹饥荒，朝廷发放米进行赈济。庚午日，月亮侵犯心宿。壬申日，月亮侵犯斗宿。丙子日，太白星侵犯昴宿。丙戌日，加封浏阳州道吾山龙神为崇惠昭应灵显广济侯。六月壬寅日，发生月食。甲辰日，火星退入南斗星区域。庚戌日，汀州路长汀县发生大水灾，平地水深可达三丈多，淹没百姓房屋八百家，毁坏民田二百顷，每户赈济钞半锭，死亡的人赈济一锭。乙卯日，达达百姓闹饥荒，赈济三个月的粮食。当月，沂州、莒州百姓闹饥荒，发放粮食进行赈济出售。
秋七月辛酉日、壬戌日，火星侵犯南斗。甲子日，火星侵犯南斗，月亮侵犯房宿。甲戌日，太白星白天出现在天空。丙子日，开放上都、兴和等地的酒禁。丁丑日，封皇姊月鲁公主为昌国大长公主。戊寅日，太白星白天出现在天空。朝廷下诏：“各位王位下的官员不得参与正常的官员选拔。”甲申日，常州宜兴山涌出水来，水势高二丈，冲坏百姓房屋。乙酉日，太白星白天出现在天空。丙戌日，太白星再次白天出现在天空。
八月丁亥日，皇帝从上都返回。戊子日，太白星白天出现在天空。祭祀社稷。己丑日，太白星再次白天出现在天空。庚寅日，宗王脱欢脱木尔各爱马的百姓闹饥荒，朝廷用三万四千九百锭钞进行赈济。宗王脱怜浑秃各爱马的百姓闹饥荒，用一万一千三百五十七锭钞进行赈济。太白星白天出现在天空。辛卯日，太白星再次白天出现在天空。甲午日，月亮侵犯斗宿。丁酉日，太白星侵犯轩辕星。戊戌日、己亥日，太白星白天出现在天空。壬寅日至甲辰日，太白星再次白天出现在天空。乙巳日，月亮侵犯昴宿。九月丁巳日，沈阳闹饥荒，百姓吃树皮，朝廷出售赈济米一千石。戊午日，太白星白天出现在天空。己未日，太白星再次白天出现在天空。
冬十月辛卯日，在太庙祭祀。壬辰日，禁止倡优穿着华丽服饰，允许男子裹青色头巾，妇女穿紫色衣服，不许戴斗笠、骑马。甲午日，朝廷下诏任命伯颜为大丞相，加元德上辅功臣的称号，赐七宝玉书龙虎金符。己亥日，火星侵犯垒壁阵星。当月，衡州闹饥荒，朝廷出售赈济米五千石。辽阳闹饥荒，赈济米五百石。文登、牟平二县闹饥荒，出售赈济米一万石。
十一月丁巳日，火星侵犯垒壁阵星。禁止宰杀牲畜。戊辰日，开封杞县人范孟造反，假传皇帝旨意，杀死河南行省平章政事月禄帖木儿、左丞劫烈、廉访使完者不花等人，不久被逮捕诛杀。癸酉日，瑞州路新昌州下冻雨，一直到第二年二月才结束。当月，八番顺元等地闹饥荒，朝廷赈济二万零二十锭钞。
十二月辛卯日，在平江重新设立都水庸田使司。在此之前曾经设置又被撤销，到这时重新设立。甲午日，月亮侵犯昴宿。癸酉日，火星侵犯外屏星。这一年，朝廷敕令赐给曲阜宣圣庙碑。工部厅梁上长出芝草，一株有七茎。袁州闹饥荒，朝廷出售赈济米五千石。胶州、密州、莒州、潍州等地闹饥荒，朝廷赈济二万锭钞。
至元六年（1340年）春正月丁卯日，月亮侵犯鬼宿。甲戌日，设立司禋监，在石佛寺供奉太祖、太宗、睿宗三朝的御容画像。乙亥日，月亮侵犯房宿。戊寅日，追封阔儿吉思为宣诚戡难翊运致美功臣、太师、开府仪同三司、上柱国，追封晋宁王，谥号忠襄。当月，察忽、察罕脑儿等地马匹遭遇灾祸，朝廷赈济六千八百五十八锭钞。邳州闹饥荒，赈济两个月的米。
二月甲申初一，朝廷下诏暂且停止今年印钞。戊子日，祭祀社稷。己丑日，月亮侵犯昴宿。丙申日，月亮侵犯太微垣。己亥日，贬黜中书大丞相伯颜为河南行省左丞相，诏书说：“朕即位以来，任命伯颜为太师、秦王、中书大丞相，然而伯颜不能安守本分，专权放肆，欺朕年幼，轻视太皇太后以及朕的弟弟燕帖古思，变乱祖宗既定的法规，残害天下百姓。对他施以极刑，才符合众人的舆论。朕念及先朝的缘故，仍存怜悯之心，如今命令伯颜出任河南行省左丞相。他原来统领的各卫亲军以及怯薛丹等人，诏书到达之时，即刻允许遣散返回。”任命太保马札儿台为太师、中书右丞相，太尉塔失海牙为太傅，知枢密院事塔马赤为太保，御史大夫脱脱为知枢密院事，汪家奴为中书平章政事，岭北行省平章政事也先帖木儿为御史大夫。增设京城米铺，以便赈济出售粮食。壬寅日，朝廷下诏：“除知枢密院事脱脱之外，诸王侯不得悬挂弓箭、环刀擅自进入内府。”癸卯日，月亮侵犯心宿。乙巳日，撤销各处船户提举司、广东采珠提举司。丁未日，月亮侵犯罗堰星。设立延徽寺，用来供奉宁宗的祭祀之事。撤销司禋监。撤销通州、河西务等地抽分按利房，大都东里山查提领所。戊申日，火星侵犯月星。己酉日，彗星大小如同房星，颜色发白，形状像粉絮，尾迹大约长五寸多。彗尾指向西南，逐渐向西北方向运行。当月，福宁州发生大水灾，淹死百姓。京畿五州十一县发大水，每户赈济两个月的米。
三月甲寅日，漳州义士陈君用袭击杀死反贼李志甫，朝廷授予陈君用同知漳州路总管府事的官职。乙卯日，益都、般阳等地闹饥荒，朝廷进行赈济。丙辰日，赦免漳州、潮州百姓被李志甫、刘虎仔胁迫而犯下的罪行，褒奖追赠战死的军将。丁巳日，大斡耳朵思遭遇风雪灾害，马匹大多死亡，朝廷用八万锭钞进行赈济。癸亥日，四怯薛役户闹饥荒，朝廷赈济一千石米、二千锭钞。成宗潜邸的四怯薛户闹饥荒，赈济二百石米、二百锭钞。任命知枢密院事脱脱、御史大夫别儿怯不花、知枢密院事牙不花主持经筵事务，中书参议阿鲁佛住兼任经筵官。月亮侵犯轩辕星。丁卯日，朝廷下诏赐给江南行台御史中丞史惟良、御史中丞耿焕、山东廉访使张友谅、中书参知政事许有壬上等美酒、束帛。庚午日，月亮侵犯房宿。辛未日，朝廷下诏将伯颜迁徙到南恩州阳春县安置。壬申日，月亮侵犯南斗。丁丑日，任命治书侍御史达识帖睦迩为奎章阁大学士，翰林直学士揭傒斯为奎章阁供奉学士。戊寅日，太白星侵犯月星。辛巳日，彗星消失，从二月己酉日到三月庚辰日，共出现三十二天。当月，淮安路山阳县闹饥荒，朝廷赈济二千五百锭钞，供给两个月的粮食。顺德路邢台县闹饥荒，赈济三千锭钞。
夏四月己丑日，在太庙祭祀。庚寅日，朝廷下诏在大天源延圣寺树立明宗神御殿碑。任命同知枢密院事铁木儿塔识为中书右丞。丙午日，朝廷下诏封马札儿台为忠王并加答剌罕的称号，马札儿台推辞不受。
五月癸丑日，禁止民间私藏军器。乙卯日，监察御史普鲁台进言：“右丞相马札儿台推辞答剌罕及王爵名号，应该公告天下，以鼓励廉洁谦让的风气。”朝廷采纳了这一建议。己未日，朝廷下诏因为党兀巴太子擒获贼寇阿答理胡，为国事牺牲，追封他为凉王，谥号忠烈。漳州龙岩尉黄佐才捕获李志甫的余党郑子箕，黄佐才在与贼寇交战时，妻子儿女四十多口都遇害，朝廷任命黄佐才为龙岩县尹。丁卯日，月亮侵犯斗宿。辛未日，朝廷发放一万锭钞，供给守卫宫阙内外门禁的唐兀、左、右阿速、贵赤、阿儿浑、钦察等卫军。丙子日，皇帝前往上都巡视。在大明殿放置每月祭祀各影堂的香，遇到行礼之时，命令省臣到殿中迎香祭祀。任命宦官伯不花为长宁寺卿。当月，济南闹饥荒，朝廷赈济一万锭钞。六月丙申日，朝廷下诏撤掉文宗庙主，将太皇太后不答失里迁徙到东安州安置，将太子燕帖古思放逐到高丽，诏书大略说：
从前我皇祖武宗皇帝去世之后，祖母太皇太后被奸邪之人迷惑，让我皇考明宗皇帝出京封到云南。英宗遇害后，正统渐渐偏离，我皇考凭借武宗嫡子的身份，逃到北方沙漠，宗王大臣同心拥戴，开创大业，当时因为距离较近，先迎接文宗，暂时总管机务。后来明白天理人伦的恰当做法，文宗假以让位之名，将宝玺献上，皇考推心置腹毫不怀疑，即刻授予他皇太子宝印。文宗恶性难改，在皇考亲自迎接他的时候，竟然和他的臣子月鲁不花、也里牙、明里董阿等人图谋不轨，让我皇考含恨离世。文宗回来后再次登上皇位，想要向天下人自我开解，就说怎么短短几天之内，皇帝就驾崩了。天下人听闻，无不切齿痛恨。他又私下图谋传位给自己的儿子，于是编造邪说，嫁祸给八不沙皇后，说朕不是明宗的儿子，于是让朕出居偏远之地。祖宗大业，几乎无法延续。他内心愧疚，就杀掉也里牙来封口。上天不保佑他，随即降下惩罚。叔婶不答失里，倚仗权势气焰，不立明宗的嫡长子，却立年幼的弟弟懿璘质班，不久弟弟也去世了，诸王大臣根据贤能和年长的标准，扶持朕登上皇位。国家的大政方针，不能顺遂实施的，数不胜数。每每想到治理国家必须以尽孝为本，做事没有比正名更重要的，仰赖上天的庇佑。权奸被罢黜，尽孝正名之事，不容再拖延，永远思念养育的无尽恩情，怎可忘记不共戴天的仇恨。以往的罪行，数不胜数，命令太常撤掉脱脱木儿在太庙的神主牌位。不答失里本是朕的婶母，却暗中勾结奸臣，不体谅朕的心意，僭越地自称太皇太后，考察她家中的祸乱，离间骨肉亲情，罪恶尤其深重，按照大义，削去她的尊号，将她迁徙到东安州安置。燕帖古思从前虽然年幼，按道理难以与朕共处，朕终究不会重蹈覆辙，一味残忍，只是将他放逐到高丽，当时贼臣月鲁不花、也里牙已死，将明里董阿等人依法严惩。
监察御史崔敬进言燕帖古思不应该被放逐，朝廷没有回复。己亥日，秦州成纪县发生山崩地裂。癸卯日，太白星在白天出现。己酉日，太白星再次在白天出现。辛亥日，太白星在白天出现，夜晚侵犯岁星。当月，济南路历城县闹饥荒，朝廷赈济二千五百锭钞。
秋七月甲寅日，太白星在白天出现。朝廷下诏封微子为仁靖公，箕子为仁献公，给比干加封为仁显忠烈公。乙卯日，奉元路盩厔县河水泛滥，冲走百姓。丁巳日，太白星在白天出现。戊午日，因为星象显示异常，大地不安宁，蝗灾旱灾接连发生，朝廷向天下颁布罪己诏。在太庙祭祀。己未日，任命亦怜真班为御史大夫。庚申日，月亮侵犯心宿。壬戌日至癸亥日，太白星在白天出现。甲子日，月亮侵犯罗堰星。乙丑日至丙寅日，太白星再次在白天出现。丁卯日，燕帖古思去世，朝廷下诏用一百锭钞准备物品祭祀他。癸酉日，太白星在白天出现。戊寅日，命令翰林学士承旨腆哈、奎章阁学士巎巎等人删修《大元通制》。庚辰日，达达之地遭遇大风雪，羊马都死了，朝廷赈济军士一百万锭钞；并且派遣使者赈济怯烈干十三站，每站一千锭。当月，禁止色目人娶叔母为妻。
八月壬午日，任命也先帖木儿为御史大夫。戊子日，祭祀社稷。当月，皇帝从上都返回。
九月辛亥初一，明里董阿被处死。癸丑日，加封汉代张飞为武义忠显英烈灵惠助顺王。辛酉日，月亮侵犯虚梁星。丙寅日，朝廷下诏：“今后有罪的人，不得将他的妻女没收配给他人。”丁卯日，月亮侵犯昴宿，火星侵犯岁星。甲戌日，月亮侵犯轩辕星。
冬十月甲申日，捧着玉册、玉宝尊奉皇考为顺天立道睿文智武大圣孝皇帝，皇帝亲自到太室行祼礼。庚寅日，奉符、长清、元城、清平四县闹饥荒，朝廷下诏派遣制国用司官员查验后进行赈济。辛卯日，各爱马人不许参与正常的官员选拔。壬辰日，建立曹南王阿剌罕、淮安王伯颜、河南王阿术的祠堂。丁酉日，太白星进入南斗星区域。己亥日，太白星侵犯斗宿。壬寅日，马札儿台辞去右丞相职务，仍然担任太师。任命脱脱为中书右丞相，宗正札鲁忽赤铁木儿不花为中书左丞相。当月，河南府宜阳等县发生大水灾，冲毁百姓房屋，淹死很多人，每人给予殡葬钞一锭，并且赈济义仓两个月的粮食。
十一月甲寅日，监察御史世图尔进言，应该禁止答失蛮、主吾人等叔伯与侄女通婚。乙卯日，月亮侵犯虚梁星。因为亲自行祼礼的大礼完成，皇帝在大明殿接受群臣朝贺。戊午日，火星侵犯氐宿。甲子日，发生月食，辰星侵犯东咸星。辛未日，任命孔克坚袭封衍圣公。戊寅日，辰星侵犯天罡星。当月，处州、婺州闹饥荒，用常平仓、义仓的粮食进行赈济。
十二月，恢复科举取士制度。国子监积分生员，三年一次，依照科举旧例参加会试，考中的录取十八名。癸未日，月亮侵犯虚梁星。乙酉日，月亮侵犯土公星。丁亥日，火星侵犯钩钤星。戊子日，撤销天历以后增设的太禧宗禋等院以及奎章阁。乙未日，火星侵犯东咸星。戊戌日，月亮侵犯明堂星。当月，东平路百姓闹饥荒，朝廷进行赈济。宝庆路下大雪，积雪深四尺五寸。
至正元年（1341年）春正月己酉初一，更改年号，诏书说：
朕认为帝王之道，品德方面没有比尽孝更重要的，治理国家没有比得到贤才更重要的。朕早年历经诸多艰难，继承大统，时常思量祖宗托付的重任，战战兢兢、小心谨慎，到如今已经八年。深切怀念皇考，长久在外操劳，刚刚登上皇位，就溘然长逝，四海百姓深感失望，朕日夜追思仰慕，难以忘怀。于是在至元六年十月初四日，捧着玉册、玉宝，追尊皇考为顺天立道睿文智武大圣孝皇帝，为其穿戴衮冕，在太室举行祼礼，以表达孝心。十一月初六日，勉强顺应大礼告成的请求，在大明殿接受群臣朝贺。从去年春天开始，向众人咨询，任命知枢密院事马札儿台为太师、右丞相，以整肃百官，亲近万民。不久他就恳请辞职，在私家宅第养病，朕多次下旨，劝勉他就职，从春到秋，他的请求越发坚决。朕怜悯他长久操劳，察觉到他的至诚之心，不忍心让政务烦扰他，让他解除机务，仍然担任太师。而知枢密院事脱脱，早年辅佐朕，尽显忠贞，于是任命他为中书右丞相；宗正札鲁忽赤帖木儿不花，曾经在官府任职，政绩显著，任命为中书左丞相，共同处理军国大事。三公探讨治国之道，来辅助朕修养品德，两位丞相总理政务，来辅佐朕治理国家，将至元七年改为至正元年，与天下百姓除旧布新。
甲寅日，火星侵犯天江星。丁巳日，在太庙祭祀。庚申日，月亮侵犯井宿。癸亥日，下诏在天寿节禁止屠宰牲畜六天。辛未日，月亮侵犯心宿。癸酉日，月亮侵犯斗宿。甲戌日，太白星在白天出现，共持续四天。当月，命令脱脱主持经筵事务。命令永明寺抄写一部金字佛经。免除天下税粮的五分之一。湖南各路闹饥荒，出售赈济米十八万九千零七十六石。
二月戊寅日，祭祀社稷。己卯日，太白星在白天出现。庚辰日，太白星再次在白天出现。辛巳日，设立广福库，撤销藏珍等库。乙酉日，济南滨州沾化等县闹饥荒，朝廷用五万三千锭钞进行赈济。丙戌日，太白星在白天出现。癸巳日，月亮侵犯明堂星。乙未日，加封皇姊不答昔你为明惠贞懿大长公主。当月，大都宝坻县闹饥荒，赈济两个月的米。河间莫州、沧州等地闹饥荒，赈济三万五千锭钞。晋州饶阳、阜平、安喜、灵寿四县闹饥荒，赈济二万锭钞。印造至元钞九十九万锭、中统钞一万锭。
三月庚戌日，撤销两淮屯田手号打捕军役，让他们隶属于本所统领。癸丑日，命令屯储御军在河南芍陂、洪泽、德安三处屯田耕种。甲寅日，归还帖木儿不花的宣让王印，镇守淮西。己未日，汴梁发生地震。大都路涿州范阳、房山闹饥荒，赈济四千锭钞。丙子日，让行省平章政事燕帖木儿佩戴虎符，提调屯田事务。当月，般阳路长山等县闹饥荒，赈济一万锭钞。彰德路安阳等县闹饥荒，赈济一万五千锭钞。
夏四月丁丑初一，道州土贼蒋丙等人造反，攻破江华县，劫掠明远县。戊寅日，彰德有赤风从西北刮起，白天昏暗如同夜晚。甲申日，在太庙祭祀。丁亥日，临贺县百姓遭受瑶族贼寇劫掠，朝廷发放义仓粮食进行赈济。庚寅日，皇帝前往护圣寺。任命中书右丞铁木儿塔识为平章政事，阿鲁为右丞，许有壬为左丞。癸巳日，设立富昌库，隶属于资正院。重新设立卫候司。丁酉日，因为两浙发生水灾，免除每年征收的余盐三万引。己亥日，设立吏部司绩官。庚子日，重新封太师马札儿台为忠王。撤销漷州河西务。彰德闹饥荒，赈济一万五千锭钞。当月，皇帝前往上都巡视。
五月戊申日，将崇文监隶属于翰林国史院。己未日，撤销河西务行用库。壬戌日，发生月食。当月，赈济阿剌忽等地受灾的三千九百一十三户百姓，发放二万一千七百零五锭钞。
闰五月丁丑初一，改封徽州土神汪华为昭忠广仁武烈灵显王。甲午日，赏赐跟随明宗的诸王官属八百零七人金银、钞币，各有不同。壬寅日，朝廷下诏刻制宣文、至正二宝。
六月戊午日，禁止高丽及其他各处百姓将亲生儿子送去做宦官，以逃避赋役。戊辰日，将旧奎章阁改为宣文阁。庚午日，月亮侵犯井宿。当月，扬州路崇明、通、泰等州，海潮汹涌泛滥，淹死一千六百多人，朝廷赈济一万一千八百二十锭钞。
秋七月己卯日，在太庙祭祀。乙酉日，月亮侵犯土星。庚寅日，月亮侵犯云雨星。
八月戊申日，祭祀社稷。当月，皇帝从上都返回。九月庚辰日，月亮侵犯建星。壬午日，在拱辰堂赏赐文臣宴饮。己丑日，冀宁路长出嘉禾，不同田亩却长出相同的稻穗。壬辰日，月亮侵犯钺星，又侵犯井宿。壬寅日，许有壬在明仁殿进讲，皇帝很高兴，在宣文阁赐酒，还赐给貂裘、金织文币。
冬十月丁未日，在太庙祭祀。己酉日，封阿沙不花为顺宁王，昔宝赤寒食为顺国公。甲寅日，中书省大臣上奏：“海运粮食不足，应该让江浙行省从中政院财赋府拨赐给众人、寺观的田粮中，总共运送二百六十万石。”皇帝同意了。乙卯日，岁星侵犯氐宿。丁巳日，月亮侵犯月星。戊午日，发生月全食。
十一月丙子日，道州路贼寇何仁甫等人造反。戊寅日，彰德所属各县各增设县尉一员。庚辰日，将吏部、礼部、兵部、刑部分为两个库，户部、工部分为两个库，各设管勾一员。己亥日，月亮侵犯东井星。庚子日，月亮侵犯天江星。瑶族贼寇侵犯边境，朝廷下诏让湖广行省平章政事巩卜班统领军队前去征讨平定，按不同情况确定赏赐。
十二月乙卯日，朝廷下诏：“百姓年满八十岁以上，蒙古人赏赐两匹缯帛，其他州县的百姓，以高年耆德之名进行表彰，免除其家中杂役。”丁巳日，太白星侵犯垒壁阵星。己未日，设立四川安岳县。增设嘉兴等地盐仓。壬戌日，云南车里寒赛、刀等人造反，朝廷下诏让云南行省平章政事脱脱木儿前去征讨平定。癸亥日，因为库存的至元钞、中统钞二百八十二万二千四百八十八锭可以支用两年，停止印造明年的钞本。朝廷下诏革除王伯颜察儿等人所献的檀、景等地的产金地土。山东、燕南强盗横行，多达三百多处，朝廷选派官员前去抓捕。重新设立拱仪局。己巳日，任命翰林学士承旨张起岩主持经筵事务。当月，重新设立司禋监。加封真定路滹沱河神为昭佑灵源侯。
元朝至正二年（公元1342年）正月，元朝皇室按例在太庙举行祭祀仪式。为改善水利交通等情况，朝廷发动了大规模的工程，征调十万役夫开挖京师的金口河，河深五十尺，宽一百五十尺。这个月，天象也有所异动，太阴星侵犯明堂，荧惑星侵犯月星。同时，多地陷入饥荒困境，大同地区饥荒严重到出现人相食的悲惨状况，朝廷紧急从京师调运粮食前往赈济；顺宁保安也闹饥荒，朝廷赈济了一万锭钞；广平的磁州、威州同样受灾，朝廷赈济了五万锭钞。在行政区划方面，咸平府被降为县，懿州则升级为路，原属大宁路的兴中、义州划归懿州管辖。
二月，朝廷颁布了《农桑辑要》，旨在指导和促进农业生产。在祭祀方面，进行了社稷祭祀。然而，这个月也出现了违法事件，李沙的伪造御宝圣旨，假冒枢密院都事，最终被依法处决。同时，朝廷安排织造明宗的御容。各地饥荒依旧严重，彰德路安阳、临漳等县，朝廷赈济了二万锭钞；大同路浑源州，朝廷以钞六万二千锭、粮二万石进行赈济；大名路获赈钞万二千锭；河间路获赈钞五万锭。
三月，元朝举行了重要的科举廷试，皇帝亲试七十八名进士，赐拜住、陈祖仁及第，其余人等也按成绩授予不同出身。但多地饥荒仍在持续，冀宁路受灾，朝廷出售赈济米三万石；顺德路平乡县获赈钞万五千锭；卫辉路获赈钞万五千锭；杭州路发生火灾，朝廷给钞万锭进行赈济。
进入夏季，四月，冀宁路平晋县发生强烈地震，声响如雷，地面裂开一尺多，居民房屋全部倾倒。皇室依旧按例在太庙举行祭祀。朝廷还采取了行政措施，罢除了云南蒙庆宣慰司。这个月，皇帝按惯例前往上都巡视。
五月，太白星白天出现在天空，这在当时被视为一种特殊的天象。人事方面，江浙行省平章政事只而瓦台调任河南行省平章政事。同时，东平遭遇严重的雹灾，冰雹大小如同马首。六月，朝廷下令江浙地区将拨赐给僧道的田产收归官府并征粮，以储备军粮。济南发生山崩，伴有水涌现象，汾水也出现了大泛滥的情况。
到了秋季七月，惠州路罗浮山发生山体崩塌。皇室在太庙进行祭祀。太阴星掩蔽太白星，太白星又在白天出现。地方上，庆远路莫八聚众造反，攻陷南丹、左右两江等处，朝廷命脱脱赤颜率军前往征讨并成功平定。为加强治安管理，朝廷在上都设立司狱司，规格比照大都兵马司。值得一提的是，这个月拂郎国进贡了一匹异马，这匹马身长一丈一尺三寸，高六尺四寸，全身纯黑，后二蹄皆为白色，十分引人注目。
八月，发生了日食现象。朝廷进行了机构调整，罢除上都事产提举司。太白星依旧在白天出现，同时进行了社稷祭祀。冀宁路饥荒情况仍未缓解，朝廷再次出售赈济米万五千石。
九月，朝廷军事行动取得成果，湖广行省平章政事巩卜班率领河南、江浙、湖广诸军成功讨伐道州贼寇，还平定了嵠峒堡寨二百余处。皇帝从上都返回。但京城治安出现问题，强贼四起。同时，太阴星侵犯罗堰和井宿。归德府睢阳县因黄河泛滥成灾，百姓陷入饥荒，朝廷出售赈济米万三千五百石进行救助。
冬季的十月，又发生了日食，太阴星侵犯建星。陕西行省平章政事朵朵因想辞职侍奉亲人，未获朝廷允许。皇室依旧按例在太庙祭祀。朝廷还派官员前往曲阜祭祀孔子，并罢除织染提举司。为调节盐业税收，杭州、嘉兴、绍兴、温州、台州等路各设立检校批验盐引所，暂时免除两浙额盐十万引，福建余盐三万引。
十一月，朝廷下诏免除云南明年的差税。当月，岁星、荧惑、太白三颗星聚集在尾宿，这一特殊的天象在当时可能引起了人们的关注和猜测。
到了十二月，朝廷重申服色之禁，以维护等级秩序。中书右丞太平、枢密副使姚庸、御史中丞张起岩被任命主持经筵事务。京师发生地震，给当地带来了一定的影响。朝廷进行了封赏，封晃火帖木儿之子彻里帖木儿为抚宁王。军事方面，赐给云南行省参知政事不老三珠虎符，命其带兵征讨死可伐。同时，阿鲁、秃满等人因谋害宰臣、企图叛逆，被依法处决，维护了朝廷的稳定和秩序。
元朝至正三年（公元1343年），新的一年伊始，朝廷内部便有官员人事变动。春正月丙子日，中书左丞许有壬辞去官职。次日丁丑，皇室依例在太庙举行祭祀仪式，以缅怀祖先、祈求庇佑。到了乙酉日，中书平章政事纳麟也选择了辞职。庚寅日，朝廷对怯薛丹的名数进行了筛选淘汰，旨在优化相关人员配置。
二月，在祭祀方面，戊戌日进行了社稷祭祀，祈求五谷丰登、国泰民安。而在天象上，甲辰日出现了太阴犯井宿，填星犯牛宿，荧惑犯罗堰的情况，在当时，这些天象变化往往被视为上天的某种警示。丁未日，朝廷在四川省设立检校官，以加强对地方的监督管理。然而，辽阳吾者野人却发生了叛乱，给当地的稳定带来了威胁。乙卯日，太阴又犯氐宿。这个月，自然灾害频发，汴梁路新郑、密二县发生地震；宝庆路闹饥荒，判官文殊奴为救济百姓，用自己所受的敕牒贷取官粮一万石进行赈济；秦州成纪县，巩昌府宁远、伏羌县则出现山崩，伴随着水涌，溺死的人数难以计数，给当地民众带来了巨大的灾难。
三月，壬申日朝廷开始建造鹿顶殿。监察御史成遵等人提出建议，认为可用终场下第举人充任学正、山长，国学生会试不中者，待遇与终场举人相同，这一建议旨在更好地利用人才资源，充实教育领域。戊寅日，朝廷下诏整顿风宪，规定在内的官员如有不法行为，由监察御史弹劾；在外的官员如有不法行为，由行台监察御史弹劾，并且规定每年八月底出巡，次年四月中返回司署。壬午日，太阴再次犯氐宿。值得一提的是，这个月朝廷下达了一项重要文化举措，下诏修撰辽、金、宋三史，任命中书右丞相脱脱为都总裁官，中书平章政事铁木儿塔识、中书右丞太平、御史中丞张起岩、翰林学士欧阳玄、侍御史吕思诚、翰林侍讲学士揭傒斯为总裁官，这对于传承和研究历史有着深远的意义。
进入夏季，四月丙申朔日，发生了日食现象。乙巳日，皇室在太庙进行祭祀。这个月，两都的桑果叶上都生出了黄色龙文，这一奇异现象在当时引起了人们的关注和猜测。同时，皇帝按惯例前往上都巡视。
五月，黄河在白茅口决堤，河水泛滥，给周边地区带来了严重的水患，百姓生活受到极大影响。六月壬子日，朝廷命令经筵官每月进讲三次，以加强文化教育和知识传播。然而，这个月回回剌里五百余人渡河，对解、吉、隰等州进行寇掠，给当地的社会秩序和百姓安全造成了威胁。中书户部鉴于国用不足的情况，请求节省不必要的开支，以缓解财政压力。
秋七月丁卯日，皇室在太庙进行祭祀。戊辰日，开始修筑大都城，这对于加强城市的防御和发展具有重要意义。戊寅日，朝廷设立永昌等处宣慰司，以更好地管理当地事务。庚辰日，太白犯右执法。这个月，兴国路遭遇大旱，而河南从四月到此时一直霖雨不止，不同地区的极端天气给农业生产和百姓生活带来了诸多困难。户部再次强调要节省钱粮，以应对可能出现的财政危机。
八月甲午朔日，晋宁路临汾县进献嘉禾，其中有一茎八穗的情况，这在当时被视为祥瑞之兆。朝廷命令朵思麻同知宣慰司事锁儿哈等人征讨四川上蓬琐吃贼。戊戌日，进行社稷祭祀。山东出现贼寇，焚烧抢掠兖州，严重破坏了当地的社会稳定。这个月，皇帝从上都返回。九月甲子日，湖广行省平章政事巩卜班将道州、贺州徭贼首领唐大二、蒋仁五擒获并押解到京城，随后将其诛杀。但他们的党羽蒋丙自号顺天王，攻破了连、桂二州，继续为祸一方。甲申日，朝廷修理太庙，派遣官员进行告祭，并将神主奉迁于后殿。
冬季的十月乙未日，朝廷在永昌增立巡防捕盗所，以加强当地的治安管理。丁酉日，进行太庙告祭，奉安神主。戊戌日，皇帝准备前往南郊祭祀，先在太庙进行告祭。当来到宁宗室时，皇帝询问：“朕是宁宗的兄长，应当拜祭吗？”太常博士刘闻回答说：“宁宗虽然是弟弟，但他为帝时，陛下是他的臣子。春秋时，鲁闵公是弟弟，僖公是兄长，闵公先成为君主，宗庙祭祀时，没听说僖公不拜。陛下应当拜祭。”于是皇帝进行了拜祭。丁未日，发生月食。己酉日，皇帝亲自在南郊祭祀上帝，以太祖配享。癸丑日，朝廷任命佥枢密院事韩元善为中书参知政事，中书参议买木丁同知宣徽院事。己未日，由于郊祀礼成，朝廷下诏大赦天下，文官普遍减一资，武官升散官一等，蠲免民间田租五分，赏赐高年者布帛，这一系列举措旨在安抚民心、稳定社会。同时，朝廷还进行了官员的调动，以湖广行省平章政事巩卜班为宣徽院使，行枢密院知院剌剌为翰林学士承旨。
十一月辛未日，皇室在太庙进行祭祀。
十二月丙申日，朝廷下诏书写金字《藏经》，这反映了当时对宗教文化的重视。丁未日，任命别儿怯不花为中书左丞相。这个月，胶州及属邑高密发生地震。河南等地百姓闹饥荒，朝廷出售赈济麦十万石，以缓解百姓的饥饿状况。这一年，朝廷下诏设立常平仓，以调节粮食供应、稳定粮价，同时罢除民间食盐的一些不合理规定。朝廷还征召遗逸之士脱因、伯颜、张瑾、杜本，其中杜本推辞没有应召。
至正四年（公元1344年），年初正月辛未日，皇室在太庙进行祭祀。辛巳日，朝廷下诏确定守令的黜陟之法，规定六事完备的守令升一等，四事完备的减一资，三事完备的平迁，六事都不完备的降一等，以此来激励官员积极履行职责。庚寅日，黄河在曹州决堤，朝廷雇佣一万五千八百名民夫进行修筑。这个月，黄河又在汴梁决堤，水患形势严峻。
二月戊戌日，进行社稷祭祀。辛丑日，四川行省设立惠民药局，旨在为民众提供医疗保障。这个月，中书右丞太平升任平章政事，朝廷内部的官员职位有所变动。
闰月辛酉朔日，永平、澧州等路发生饥荒，朝廷进行赈济，以帮助百姓度过难关。乙亥日，发生月食。三月丁酉日，重新设立武功县。壬寅日，朝廷特授八秃麻朵儿只征东行省左丞相，继承高丽国王之位。癸丑日，任命河南行省平章政事纳麟为中书平章政事，集贤大学士姚庸为中书左丞，进一步调整了朝廷的官员配置。
夏四月丁亥日，重新设立广样局。这个月，皇帝按惯例前往上都巡视。
五月乙未日，右丞相脱脱请求辞职，朝廷起初不允许；甲辰日，朝廷同意了他的请求，任命阿鲁图为中书右丞相。乙巳日，朝廷封脱脱为郑王，食邑在安丰，赐金印及海青、文豹等物，但脱脱都推辞不受。这个月，天降大霖雨，黄河水泛滥，平地水深达二丈，白茅堤、金堤决口，曹、濮、济、兖等地都遭受了灾害，百姓流离失所，损失惨重。六月戊辰日，巩昌陇西县闹饥荒，每户从常平仓借贷粟三斗，等年成丰收时再归还官府。己巳日，朝廷赐给脱脱松江田，并为其设立松江等处稻田提领所。
秋七月戊子朔日，温州遭遇飓风，海水倒灌，同时发生地震，给当地带来了巨大的破坏。益都濒海的盐徒郭火你赤发动叛乱，给社会秩序带来了不稳定因素。己丑日，皇室在太庙进行祭祀。这个月，滦河水泛滥，进一步加剧了水患的影响。
八月戊午日，进行社稷祭祀。丁卯日，山东因霖雨导致百姓饥荒，甚至出现人相食的悲惨景象，朝廷进行赈济。丙戌日，朝廷赐给脱脱金十锭、银五十锭、钞万锭、币帛二百匹，脱脱推辞不受。这个月，陕西行省设立惠民药局。莒州蒙阴县发生地震。郭火你赤率领叛乱队伍上太行，由陵川进入壶关，到达广平，杀死兵马指挥后，又返回益都，其行为严重威胁到了地方的安全。这个月，皇帝从上都返回。九月丁亥朔日，发生日食。丙午日，朝廷命令太平提调都水监，以加强对水利事务的管理。辛亥日，任命南台治书侍御史秦从德为江浙行省参知政事，提调海运，以保障物资的运输。癸丑日，朝廷命令御史大夫也先帖木儿、平章政事铁木儿塔识主持经筵事，右丞达识帖睦迩提调宣文阁、知经筵事，以推动文化教育事业的发展。
冬十月乙酉日，朝廷开始商议修筑黄河、淮河的堤堰，以应对水患问题。
十一月丁亥朔日，鉴于各郡县百姓饥荒的情况，朝廷下令不许强行摊派食盐。同时，再次允许民众缴纳粟米来补官，以筹备赈济物资。戊子日，朝廷禁止内外官民宴会使用珠花，旨在倡导节俭之风。己亥日，保定路闹饥荒，朝廷以钞八万锭、粮万石进行赈济。戊申日，河南百姓饥荒，朝廷下令禁酒，以节约粮食资源。
十二月己未日，四川廉访司建议：“广元等五路，广安等三府，永宁等两宣抚司，请求依照内郡设置推官一员。”朝廷采纳了这一建议。壬戌日，太阴犯外屏。癸亥日，汉阳发生地震。戊寅日，徭贼侵犯靖州，给当地的安全带来了威胁。
这个月，东平发生地震。朝廷禁止不合规定的淫祠，以整顿社会风气。同时，朝廷赈济东昌、济南、般阳、庆元、抚州的饥民，帮助他们度过难关。这一年，徭贼侵犯浔州，同知府事保童率领民兵将其击退，维护了当地的社会稳定。
元朝至正五年（公元1345年），新的一年在祭祀中拉开帷幕。正月辛卯日，皇室依例在太庙举行祭祀仪式，缅怀祖先，祈求庇佑。然而，这个月蓟州发生了地震，给当地带来了一定的震动和影响。
二月戊午日，进行了社稷祭祀，祈求五谷丰登、国家安宁。
三月辛卯日，皇帝亲自对七十八名进士进行殿试，赐普颜不花、张士坚进士及第，其余人等也按成绩赐予不同的出身。这个月，陈思谦被任命为参议中书省事。在此之前，陈思谦曾建言：“各地盗贼兴起，是因为年成饥荒、百姓贫困，应当大量打开仓库进行赈济，以收服人心，同时分布重兵镇守和安抚中原地区。”但他的建议未被采纳。此时，大都、永平、巩昌、兴国、安陆等处以及桃温万户府各翼的百姓陷入饥荒，朝廷进行了赈济，以缓解他们的困境。
进入夏季，四月丁卯日，对于大都的流民，官府提供路粮，遣送他们返回故乡，希望他们能在故土重新安定生活。这个月，汴梁、济南、邠州、瑞州等地的百姓也遭受饥荒，朝廷同样进行了赈济。同时，朝廷招募富户，规定出米五十石以上的富户，赐予“义士”的称号加以表彰，以鼓励社会力量参与到赈济活动中。这个月，皇帝按惯例前往上都巡视。
五月己丑日，朝廷下诏，将军士所掠的云南子女一千一百人释放，让他们回到家乡，并提供行粮。对于那些不愿回乡的人，也听其自愿。丁未日，河间转运司的灶户遭受水灾，朝廷下诏暂时免除余盐二万引，等到年成丰收时再补还官府，以减轻灶户的负担。六月，庐州的张顺兴拿出五百余石米赈济饥民，朝廷对其家门进行表彰，以弘扬这种善举。
秋七月丁亥日，黄河在济阴决堤，河水泛滥，给周边地区带来了严重的水患。己丑日，皇室在太庙进行祭祀。丙午日，朝廷任命也先帖木儿、铁木儿塔识同为御史大夫，并下诏整顿风纪，希望能改善官场风气。
八月戊午日，进行社稷祭祀。这个月，皇帝从上都返回。九月辛巳朔日，发生日食。戊戌日，朝廷开放酒禁。辛丑日，朝廷对官员进行了调整，任命中书右丞达识帖睦迩为翰林学士承旨，中书参知政事搠思监为右丞，资政院使朵儿直班为中书参知政事。这个月，朝廷革除了奥鲁这一机构。
冬季的十月壬子日，朝廷任命中书平章政事太平为御史大夫。乙卯日，皇室在太庙进行祭祀。辛酉日，朝廷命令奉使宣抚巡行天下，并下诏说：“朕自登基以来，至今已有十多年，虽居于亿兆民众之上，身处九重深宫之中，但耳目所及之处，怎能全面了解情况？所以尽管朕日夜忧虑勤勉，希望让百姓安居乐业，但祥和之气尚未到来，灾害不时发生，声威教化未能普及，风俗不够淳朴，官吏的弊端未能消除，百姓的疾苦更加严重。难道是承担宣达使命的官员和负责纠察弹劾的部门，在执行过程中有所不到位的地方吗？参照先朝的既定法规，派遣官员分道奉使宣抚，宣扬朕的德意，询问民众的疾苦，清理积压的冤屈案件，废除繁琐苛刻的政令。考察官吏的贤能与否，明确进行升降奖惩，有罪的官员，四品以上停职并申请处理，五品以下可以就便处决。民间一切有利于兴利除害的事情，都听任其举行。”朝廷任命江西行省左丞忽都不丁、吏部尚书何执礼巡视两浙江东道；前云南行省右丞散散、将作院使王士弘巡视江西福建道；大都路达鲁花赤拔实、江浙行省参知政事秦从德巡视江南湖广道；吏部尚书定僧、宣政佥院魏景道巡视河南江北道；资政院使蛮子、兵部尚书李献巡视燕南山东道；兵部尚书不花、枢密院判官靳义巡视河东陕西道；宣政院同知伯家奴、宣徽佥院王也速迭儿巡视山北辽东道；荆湖北道宣慰使阿乞剌、两淮运使杜德远巡视云南省；上都留守阿牙赤、陕西行省左丞王绅巡视甘肃永昌道；大都留守答尔麻失里、河南行省参知政事王守诚巡视四川省；前西台中丞定定、集贤侍讲学士苏天爵巡视京畿道；平江路达鲁花赤左答纳失里、都水监贾惟贞巡视海北海南广东道。此时黄河泛溢，给沿岸地区带来了巨大的灾难。辛未日，辽、金、宋三史修成，右丞相阿鲁图进献给皇帝，皇帝说：“史书既然已经成书，前人好的方面，朕应当取来作为效法的榜样，不好的方面则作为警戒。然而，这岂止是对为君者有激励劝诫作用，为臣者也应当知晓其中的道理。你们应当体会朕的心意，以前代的善恶为借鉴，勉励自己。”己卯日，监察御史不答失里请求停止那些并非急需的建造事务，以节省资源。这个月，吕思诚被任命为中书参知政事。
十一月甲午日，《至正条格》修成。奉元路的陈望叔伪称自己是燕帖古思太子，最终被处决，维护了朝廷的秩序和权威。
十二月丁巳日，朝廷下诏确定荐举守令的法规，以选拔更优秀的地方官员。这一年，宣徽院使笃怜铁穆迩担任知枢密院事，冯思温担任御史中丞，朝廷的官员配置进一步调整。
至正六年（公元1346年），二月庚戌朔日，发生日食。辛未日，兴国降下冰雹，大的如同马首，给当地的农业生产和百姓生活带来了损害。这个月，山东发生地震，持续了七天才停止，造成了一定的破坏。
三月辛未日，盗贼扼守李开务的闸河，劫掠商旅船只，严重影响了水上交通和商业往来。两淮运使宋文瓒进言：“世祖皇帝开通会通河一千多里，每年运米到京城达五百万石。如今不过四十名骑贼，却能劫走三百艘船，却无人能捕获，恐怕运道会阻塞，请求选派能干的大臣率领一千名壮勇骑兵前去捕获盗贼。”但他的建议未被采纳。戊申日，京畿地区盗贼兴起，范阳县请求增设县尉和巡警兵，朝廷同意了这一请求，以加强治安管理。山东也出现盗贼，朝廷下诏让中书参知政事锁南班到东平镇遏制盗贼。八番的龙宜来进献马匹，表达对朝廷的敬意。
进入夏季，四月壬子日，辽阳地区因为捕捉海东青而对百姓造成烦扰，吾者野人及水达达都发动了叛乱，局势变得紧张。癸丑日，长吉被任命为皇太子宫傅官。朝廷将《至正条格》颁布于天下，以规范社会秩序。甲寅日，中书参知政事吕思诚升任左丞。乙卯日，皇室在太庙进行祭祀。丁卯日，皇帝按惯例前往上都巡视。朝廷发放二十万石米进行赈济出售，以帮助贫民度过难关。万户买住等人讨伐吾者野人时遇害，朝廷下诏抚恤他们的家人，以表彰他们的付出。同时，中书左丞吕思诚被任命主持经筵事，朝廷还命令左右二司、六部的吏属在午后讲习经史，以提高官员的文化素养。
五月壬午日，陕西发生饥荒，朝廷下令禁酒，以节约粮食。象州出现盗贼，社会秩序受到影响。江西田赋提举司因扰民而被罢除，以减轻百姓的负担。丁亥日，太庙的神主被盗，这一事件引起了朝廷的重视。朝廷派遣火儿忽答讨伐吾者野人，以平定叛乱。丁酉日，由于黄河决口，朝廷设立河南山东都水监，专门负责治理黄河水患。六月己酉日，汀州连城县的百姓罗天麟、陈积万叛乱，攻陷长汀县，福建元帅府经历真宝、万户廉和尚等人奉命前往讨伐。丁巳日，朝廷下诏，因为云南贼寇死可伐占据一方，侵夺路甸，命令亦秃浑为云南行省平章政事前去讨伐，以恢复当地的秩序。
秋七月己卯日，皇室在太庙进行祭祀。丙戌日，由于辽阳吾者野人等叛乱尚未平定，朝廷任命太保伯撒里为辽阳行省左丞相，镇守当地，以稳定局势。丁亥日，朝廷下诏招谕死可伐，希望能通过和平方式解决问题。散毛洞蛮覃全在叛乱后又被招降，朝廷任命他为散毛誓厓等处军民宣抚使，设置官属，给予宣敕、虎符，并设立驿铺，以加强对当地的管理。癸巳日，朝廷下诏选拔怯薛官担任路、府、县达鲁花赤，调整地方官员的配置。丙申日，朝廷任命朵儿直班为中书右丞，答儿麻为参知政事。壬寅日，朝廷任命御史大夫亦怜真班等人主持经筵事。甲辰日，京畿奉使宣抚定定上奏御史撒八儿等人的罪行，朝廷将他们杖责并黜免。当时各道奉使，大多与台宪互相包庇隐瞒，只有定定与湖广道的拔实能够纠察举报，毫不回避。
八月丙午朔日，朝廷命令江浙行省右丞忽都不花、江西行省右丞秃鲁统领军队共同讨伐罗天麟。戊申日，进行社稷祭祀。这个月，皇帝从上都返回。九月乙酉日，朝廷军队收复长汀，取得了平叛的阶段性胜利。戊子日，邵武发生地震，发出如同击鼓的声音，到夜晚又再次鸣响，给当地民众带来了恐慌。
冬季的十月，思州、靖州的徭寇侵犯武冈，朝廷下诏让湖广省臣及湖南宣慰元帅完者帖木儿前去讨伐，俘获和斩杀数百人，徭贼战败逃走，维护了当地的安全。
闰月乙亥朔日，朝廷下诏大赦天下，免除差税的三分，水旱灾害严重的地方则全部免除差税，以减轻百姓的负担。靖州的徭贼吴天保攻陷黔阳，局势再度紧张。癸未日，汀州的贼徒罗德用杀死首贼罗天麟、陈积万，并将首级送到官府，其余党羽也全部被平定，汀州地区恢复了平静。
十二月丁丑日，省臣改拟明宗母亲寿童皇后的徽号为庄献嗣圣皇后，以表示对皇室先人的尊崇。己卯日，朝廷改立山东东西道宣慰使司都元帅府，开设屯田，驻扎军马，以加强对山东地区的管理和防御。甲申日，朝廷下诏重新设立大护国仁王寺昭应宫财用规运总管府，该府共贷民间钱二十六万余锭。辛卯日，有关部门因为赏赐泛滥，上奏请求恩赐必须先经过省、台、院的商定拟议，以规范赏赐制度。甲午日，朝廷设立海剌秃屯田二处，以促进农业生产和经济发展。朝廷下诏：“犯贪污罪的人，不得在常规选官中任用。”朝廷重新设立八百宣慰司，让土官韩部袭其父爵，以维护当地的统治秩序。辛丑日，朝廷任命吉剌班为太尉，开设官府，设置僚属。壬寅日，山东、河南盗贼兴起，朝廷派遣左、右阿速卫指挥不儿国等人前去讨伐，以平定盗贼，恢复社会的安宁。这一年，黄河再次决口，尚书李絅请求亲自祭祀郊庙，亲近正直的人，远离奸邪谄媚之徒，以崇尚阳刚抑制阴邪，但他的请求未被采纳。